- 干货！我国部分地区的北美洲型PRRSV的分离鉴定及重组分析 - 猪病
- 发布时间：2019-09-27 14:13 浏览：加载中
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引言
近年来，关于猪繁殖与呼吸综合征病毒 (porcine reproductive and respiratorysyndrome virus, PRRSV)重组的报道较多。重组不仅发生在PRRSV野毒之间[1]，还发生在PRRSV野毒与弱毒疫苗株之间[2, 3]，这给PRRSV的流行病学监测、疫苗安全以及疫病防控带来了困难。为进一步了解目前我国PRRSV流行及重组情况，本研究对国内2014-2017年来自于黑龙江、河南、辽宁等9个省份的PRRSV阳性临床样品进行了病毒分离。
材料与方法
本研究取研磨后的组织样品上清液进行稀释，过滤后在MARC-145和PAM细胞上进行病毒分离，共分离到12株北美洲型PRRSV。其中只有1株能感染MARC-145细胞，另外11株只能感染PAM细胞。利用PRRSV全长扩增引物，对12株毒株进行全基因组扩增后，进行序列拼接，全长基因组大小范围为15013-15322nt（不含poly A序列）。其中7株与PRRSV NADC30的核苷酸同源性为92.2-94.8%，5株与PRRSV HuN4的核苷酸同源性为98.7-99.3%。
结果与讨论
利用Simplot软件进行全基因组序列的重组分析。结果发现，7株NADC30-like PRRSV毒株全部发生重组，其中6株PRRSV的重组发生在分支1与分支8之间，1株毒株的重组发生在分支1与分支5之间。5株HP-PRRSV中仅有1株发生重组，其主要亲本为分支8 PRRSV、次要亲本为分支1 PRRSV。这些毒株的分支间重组区域多数定位于非结构蛋白区域。结果表明，北美洲型PRRSV间重组的情况比较复杂，这提示我们需要加强对NADC30-like PRRSV毒株的监测，关注PRRSV重组毒株的传播，制定更加合理的PRRS防控策略。
主要参考文献
[1]Li Bin, Fang Liu-rong, Xu Zuo-fei, et al. Recombination in vaccine and circulatingstrains of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses [J]. EmergInfect Dis, 2009, 15(12): 2032-2035.
[2]Lu Wen-hui, Tun H M, Sun Bao-li, et al. Re-emerging of porcine respiratory andreproductive syndrome virus (lineage 3) and increased pathogenicity aftergenomic recombination with vaccine variant [J]. Vet Microbiol, 2015, 175(2-4):332-340.
[3]Zhao Hua-jian, Han Qing-gong, Zhang Lei, et al. Emergence of mosaic recombinantstrains potentially associated with vaccine JXA1-R and predominant circulatingstrains of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in differentprovinces of China [J]. Virol J, 2017, 14(1): 67.
